Japan-Places.com listou aprox 40 Museu de zoologias dentro Japão. Alguns dos mais bem avaliados Museu de zoologias dentro Japão estão- Hanzaki Center, Museu do Marisco da Cidade de Nishinomiya, Museu Municipal do Guindaste de Izumi - Parque do Crane Izumi, Centro de Conservação da Vida Selvagem de Utonaiko, Zoológico Natural, Museu Shigasafari, Centro de Frango Nagao, Konchukan, Sociedade de Preservação da Cobra Branca de Iwakuni & Museu Higma.