Japan-Places.com listou aprox 262 Museu da Ciência dentro Japão. Alguns dos mais bem avaliados Museu da Ciência dentro Japão estão- Museu de Ciências da Cidade de Chiba, Museu de Ciência da Prefeitura de Yamanashi, Museu de Ciências Espaciais no Centro Espacial Tanegashima, Museu de Ciências de Fukuoka, Centro de Exposições da Ponte Akashi Kaikyo, Museu da Energia Nuclear de Hamaoka, Museu da Ciência Asahikawa, Museu da Ciência da Água de Tóquio, Museu Municipal de Ciências de Kawasaki & Centro Municipal de Ciências de Kyoto para Jovens.