Japan-Places.com listou aprox 262 Museu da Ciência dentro Japão. Alguns dos mais bem avaliados Museu da Ciência dentro Japão estão- Museu Nacional da Natureza e Ciência, Museu Nacional de Ciência Emergente e Inovação, Museu da Ciência de Osaka, Museu de Ciências Aeronáuticas, Museu de Ciências, Museu Okhotsk Ryū hyō, Museu de Ciências da Cidade de Fukuoka, Misawa Aviation & Science Museum, Misawa Aviation & Science Museum & Água de Okutama e Salão da Amizade verde.