Japan-Places.com listou aprox 3 Institutos de pesquisa dentro Cidade de Shinjuku. Alguns dos mais bem avaliados Institutos de pesquisa dentro Cidade de Shinjuku estão- Instituto Nacional de Doenças Infecciosas Edifício Toyama Research Office, Instituto Nacional de Saúde e Nutrição & Instituto de Pesquisa do Centro Kokuritsu Kokusai Iryokenkyu.