Japan-Places.com listou aprox 90 Heritage musea dentro Japão. Alguns dos mais bem avaliados Heritage musea dentro Japão estão- Museu Yamato (Museu Marítimo Kure), Sapporo Beer Museum, Navio de guerra com memorial histórico de Mikasa, Museu de História Antiga de Izumo da Prefeitura de Shimane, Museu de História Antiga de Izumo da Prefeitura de Shimane, Museu da Antiga Izumo, Museu da cidade de Sendai, Museu de História Koshien, Museu de História e Cultura de Nagasaki & Panasonic Museum.
