Japan-Places.com listou aprox 824 Jardins botânicos dentro Japão. Alguns dos mais bem avaliados Jardins botânicos dentro Japão estão- Parque de Frutas Togokusan, Rokko Alpine Botanical Garden, Jardim Botânico de Miyako Qingdao, Jardim de rosas de Higashizawa, Jardim de Rosas de Higashizawa, Yumenoshima Tropical Greenhouse Dome, Yumenoshima Tropical Greenhouse Dome, Jardim Irago nanohana, Parque Suigo Sawara Ayame & Museu de plantas ambientais tropicais de Itabashi.